Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00597Q9H2U6 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms