Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU5

GRIN3A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3AQ8TCU5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIN3AQ8TCU5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms