Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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