Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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