Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SAMD13Q5VXD3 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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