Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms