Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms