Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.1 ms