Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms