Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms