Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK18Q07002 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK18Q07002 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms