Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COG7P83436 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COG7P83436 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG7P83436 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms