Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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