Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP13P45452 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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MMP13P45452 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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MMP13P45452 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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MMP13P45452 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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MMP13P45452 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP13P45452 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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