Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms