Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TSPOP30536 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TSPOP30536 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TSPOP30536 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms