Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCAP01258 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCAP01258 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCAP01258 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCAP01258 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCAP01258 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCAP01258 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCAP01258 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCAP01258 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCAP01258 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCAP01258 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALCAP01258 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALCAP01258 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms