Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSFQ9UBX1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSFQ9UBX1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSFQ9UBX1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSFQ9UBX1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSFQ9UBX1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSFQ9UBX1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSFQ9UBX1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSFQ9UBX1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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