Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPERQ9BY12 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms