Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3CQ99985 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms