Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGSM1Q2NKQ1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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