Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC27Q2M243 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms