Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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NDUFA9Q16795 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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NDUFA9Q16795 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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NDUFA9Q16795 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NDUFA9Q16795 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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