Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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ZNF56Q15929 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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ZNF56Q15929 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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ZNF56Q15929 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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ZNF56Q15929 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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ZNF56Q15929 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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