Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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