Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TAF1AQ15573 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TAF1AQ15573 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TAF1AQ15573 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TAF1AQ15573 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TAF1AQ15573 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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