Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms