Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms