Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC3Q14574 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms