Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CDH18Q13634 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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