Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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