Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXI1Q12951 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms