Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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