Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms