Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms