Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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