Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms