Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms