Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZBTB37-202ENST00000367702 1337 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OR2A5-201ENST00000408906 1013 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CIDECP-203ENST00000424691 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KRT18P12-201ENST00000425245 1273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms