Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSL1

UBAC1, Ubiquitin-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAC1Q9BSL1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAC1Q9BSL1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms