Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 USP2-AS1-201ENST00000498979 2486 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 POTEJ-201ENST00000409602 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 TCF4-209ENST00000544241 2264 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ZNF665-206ENST00000600412 2273 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 RPLP0P2-206ENST00000496593 3525 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 HTR4-202ENST00000362016 2979 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 MYOCOS-204ENST00000637642 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 YME1L1-207ENST00000477432 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 CTAGE4-201ENST00000486333 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 CTAGE8-201ENST00000487179 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 EPC1-201ENST00000263062 2913 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 CASP7-203ENST00000369318 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC004584.3-201ENST00000572877 2356 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ZSWIM5P1-201ENST00000420606 1970 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 OR13C9-201ENST00000259362 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC012048.1-201ENST00000622980 595 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC003101.3-201ENST00000624452 768 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 LETM2-207ENST00000523983 1776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 RBM23-204ENST00000399922 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SPATA41-202ENST00000560282 2072 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 PCDHB11-201ENST00000354757 4198 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ADGRG1-201ENST00000388813 3925 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 PCID2-206ENST00000375479 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ZMAT3-201ENST00000311417 9406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ADGRG1-202ENST00000456916 3860 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AMPD2-205ENST00000393688 3217 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 GSG1-203ENST00000396302 1628 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 CLEC4M-202ENST00000327325 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 ACKR1-204ENST00000537147 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 TRPV3-201ENST00000301365 3235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SVIPQ8NHG7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms