RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498979.6

USP2-AS1-201, Transcript of USP2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP2-AS1, Length 2,486 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2-AS1-201ENST00000498979 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.44■□□□□ 0.7
USP2-AS1-201ENST00000498979 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
USP2-AS1-201ENST00000498979 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.05■□□□□ 0.32
USP2-AS1-201ENST00000498979 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.97■□□□□ 0.31
USP2-AS1-201ENST00000498979 ABCC9O60706 1549 aa16.46■□□□□ 0.23
USP2-AS1-201ENST00000498979 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.3■□□□□ 0.2
USP2-AS1-201ENST00000498979 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
USP2-AS1-201ENST00000498979 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.97■□□□□ 0.15
USP2-AS1-201ENST00000498979 NACADO15069 1562 aa15.89■□□□□ 0.13
USP2-AS1-201ENST00000498979 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.86■□□□□ 0.13
USP2-AS1-201ENST00000498979 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.85■□□□□ 0.13
USP2-AS1-201ENST00000498979 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa15.83■□□□□ 0.12
USP2-AS1-201ENST00000498979 SCRIBQ14160 1630 aa15.71■□□□□ 0.11
USP2-AS1-201ENST00000498979 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.57■□□□□ 0.08
USP2-AS1-201ENST00000498979 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
USP2-AS1-201ENST00000498979 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.44■□□□□ 0.06
USP2-AS1-201ENST00000498979 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
USP2-AS1-201ENST00000498979 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.22■□□□□ 0.03
USP2-AS1-201ENST00000498979 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP2-AS1-201ENST00000498979 HRCP23327 699 aa15.08■□□□□ 0
USP2-AS1-201ENST00000498979 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.07■□□□□ 0
USP2-AS1-201ENST00000498979 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
USP2-AS1-201ENST00000498979 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.01□□□□□ -0.01
USP2-AS1-201ENST00000498979 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP2-AS1-201ENST00000498979 SMARCA4P51532 1647 aa14.99□□□□□ -0.01
USP2-AS1-201ENST00000498979 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP2-AS1-201ENST00000498979 MYT1Q01538 1121 aa14.93□□□□□ -0.02
USP2-AS1-201ENST00000498979 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP2-AS1-201ENST00000498979 WIZO95785 1651 aa14.93□□□□□ -0.02
USP2-AS1-201ENST00000498979 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.83□□□□□ -0.03
USP2-AS1-201ENST00000498979 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.83□□□□□ -0.04
USP2-AS1-201ENST00000498979 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.76□□□□□ -0.05
USP2-AS1-201ENST00000498979 SMARCA2P51531 1590 aa14.74□□□□□ -0.05
USP2-AS1-201ENST00000498979 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.73□□□□□ -0.05
USP2-AS1-201ENST00000498979 NCAPD3P42695 1498 aa14.71□□□□□ -0.05
USP2-AS1-201ENST00000498979 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP2-AS1-201ENST00000498979 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP2-AS1-201ENST00000498979 HMGXB3Q12766 1538 aa14.63□□□□□ -0.07
USP2-AS1-201ENST00000498979 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.6□□□□□ -0.07
USP2-AS1-201ENST00000498979 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP2-AS1-201ENST00000498979 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP2-AS1-201ENST00000498979 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP2-AS1-201ENST00000498979 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.49□□□□□ -0.09
USP2-AS1-201ENST00000498979 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP2-AS1-201ENST00000498979 NESP48681 1621 aa14.39□□□□□ -0.11
USP2-AS1-201ENST00000498979 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.34□□□□□ -0.11
USP2-AS1-201ENST00000498979 CFTRP13569 1480 aa14.33□□□□□ -0.12
USP2-AS1-201ENST00000498979 SLC24A1O60721 1099 aa14.31□□□□□ -0.12
USP2-AS1-201ENST00000498979 TRIM41Q8WV44 630 aa14.29□□□□□ -0.12
USP2-AS1-201ENST00000498979 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
USP2-AS1-201ENST00000498979 ABCC8Q09428 1581 aa14.25□□□□□ -0.13
USP2-AS1-201ENST00000498979 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.22□□□□□ -0.13
USP2-AS1-201ENST00000498979 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
USP2-AS1-201ENST00000498979 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.19□□□□□ -0.14
USP2-AS1-201ENST00000498979 PRDM2Q13029 1718 aa14.16□□□□□ -0.14
USP2-AS1-201ENST00000498979 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.14□□□□□ -0.15
USP2-AS1-201ENST00000498979 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.14□□□□□ -0.15
USP2-AS1-201ENST00000498979 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.12□□□□□ -0.15
USP2-AS1-201ENST00000498979 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.1□□□□□ -0.15
USP2-AS1-201ENST00000498979 SYNJ1O43426 1573 aa14.1□□□□□ -0.15
USP2-AS1-201ENST00000498979 CUX1P39880 1505 aa14.09□□□□□ -0.15
USP2-AS1-201ENST00000498979 ERCC6Q03468 1493 aa14.07□□□□□ -0.16
USP2-AS1-201ENST00000498979 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
USP2-AS1-201ENST00000498979 TOPBP1Q92547 1522 aa14.01□□□□□ -0.17
USP2-AS1-201ENST00000498979 TOP2BQ02880 1626 aa14□□□□□ -0.17
USP2-AS1-201ENST00000498979 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.99□□□□□ -0.17
USP2-AS1-201ENST00000498979 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP2-AS1-201ENST00000498979 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.98□□□□□ -0.17
USP2-AS1-201ENST00000498979 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.98□□□□□ -0.17
USP2-AS1-201ENST00000498979 CUX2O14529 1486 aa13.98□□□□□ -0.17
USP2-AS1-201ENST00000498979 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.97□□□□□ -0.17
USP2-AS1-201ENST00000498979 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.96□□□□□ -0.17
USP2-AS1-201ENST00000498979 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
USP2-AS1-201ENST00000498979 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.94□□□□□ -0.18
USP2-AS1-201ENST00000498979 SOGA1O94964 1423 aa13.94□□□□□ -0.18
USP2-AS1-201ENST00000498979 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.94□□□□□ -0.18
USP2-AS1-201ENST00000498979 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
USP2-AS1-201ENST00000498979 WDR62O43379 1518 aa13.91□□□□□ -0.18
USP2-AS1-201ENST00000498979 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
USP2-AS1-201ENST00000498979 EEA1Q15075 1411 aa13.88□□□□□ -0.19
USP2-AS1-201ENST00000498979 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.87□□□□□ -0.19
USP2-AS1-201ENST00000498979 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
USP2-AS1-201ENST00000498979 TNIKQ9UKE5 1360 aa13.83□□□□□ -0.19
USP2-AS1-201ENST00000498979 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
USP2-AS1-201ENST00000498979 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
USP2-AS1-201ENST00000498979 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
USP2-AS1-201ENST00000498979 BCL11AQ9H165 835 aa13.81□□□□□ -0.2
USP2-AS1-201ENST00000498979 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
USP2-AS1-201ENST00000498979 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.79□□□□□ -0.2
USP2-AS1-201ENST00000498979 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
USP2-AS1-201ENST00000498979 CEP162Q5TB80 1403 aa13.77□□□□□ -0.21
USP2-AS1-201ENST00000498979 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
USP2-AS1-201ENST00000498979 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.76□□□□□ -0.21
USP2-AS1-201ENST00000498979 KIF27Q86VH2 1401 aa13.76□□□□□ -0.21
USP2-AS1-201ENST00000498979 IFT140Q96RY7 1462 aa13.76□□□□□ -0.21
USP2-AS1-201ENST00000498979 WDR97A6NE52 1622 aa13.75□□□□□ -0.21
USP2-AS1-201ENST00000498979 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
USP2-AS1-201ENST00000498979 IGF1RP08069 1367 aa13.72□□□□□ -0.21
USP2-AS1-201ENST00000498979 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
USP2-AS1-201ENST00000498979 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms