Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms