Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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