Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms