Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IMPG1Q17R60 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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