Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 FGFR1-221ENST00000484370 826 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.314e-7■■□□□ 12.5
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PCBP2Q15366 FGFR1-229ENST00000526742 657 ntTSL 49.71□□□□□ -0.864e-7■■□□□ 12.5
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PCBP2Q15366 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.056e-13■■□□□ 12.5
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PCBP2Q15366 AES-212ENST00000592414 3274 ntTSL 212.04□□□□□ -0.481e-8■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 LRP1-211ENST00000556356 5114 ntTSL 214.72□□□□□ -0.053e-8■■□□□ 12.5
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PCBP2Q15366 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.121e-16■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.187e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.067e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 FAM189B-209ENST00000497941 871 ntTSL 217.26■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 12.4
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PCBP2Q15366 FGFR1-222ENST00000487647 1608 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.094e-7■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 FGFR1-235ENST00000530701 276 ntTSL 1 (best)2.63□□□□□ -1.994e-7■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 TM7SF2-217ENST00000530650 2094 ntTSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.012e-9■■□□□ 12.4
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PCBP2Q15366 TM7SF2-204ENST00000524986 729 ntTSL 317.51■□□□□ 0.392e-9■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.252e-9■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.034e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 TM7SF2-207ENST00000526085 570 ntTSL 514.53□□□□□ -0.082e-9■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.184e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 MAP3K4-215ENST00000544041 5444 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.34e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 MAP3K4-207ENST00000490904 5451 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.314e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 LEMD1-211ENST00000629624 576 ntTSL 410.36□□□□□ -0.759e-7■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 ASB16-AS1-203ENST00000591166 754 ntTSL 38.02□□□□□ -1.132e-9■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 ASB16-AS1-202ENST00000588785 574 ntTSL 36.16□□□□□ -1.422e-9■■□□□ 12.4
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PCBP2Q15366 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.652e-9■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.652e-9■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.72e-9■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.722e-9■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.792e-9■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-10■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 DHRS1-210ENST00000561273 2027 ntTSL 515.59■□□□□ 0.092e-10■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 DHRS1-204ENST00000558340 1623 ntTSL 513.42□□□□□ -0.262e-10■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 DHRS1-207ENST00000559483 629 ntTSL 312.58□□□□□ -0.42e-10■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 DHRS1-202ENST00000396813 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-10■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 TTC27-201ENST00000317907 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 TTC27-203ENST00000433416 660 ntTSL 38.61□□□□□ -1.032e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-8■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 PLPP3-203ENST00000461655 646 ntTSL 34.73□□□□□ -1.652e-8■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 MBTPS2-203ENST00000465888 1862 ntTSL 218.14■□□□□ 0.491e-13■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 MBTPS2-202ENST00000379484 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.761e-13■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.211e-13■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 COL27A1-205ENST00000485397 463 ntTSL 517.67■□□□□ 0.422e-13■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.66e-8■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 USP10-202ENST00000540269 3070 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 12.4
PCBP2Q15366 USP10-207ENST00000563048 1315 ntTSL 210.97□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 12.4
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