Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms