Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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