Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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